單細(xì)胞測序平民化，測一個細(xì)胞僅需一美分，一次能測上千個細(xì)胞！

來自艾倫學(xué)院和華盛頓大學(xué)的科學(xué)家們開發(fā)出了一種廉價的高級技術(shù)可以檢測成百上千個細(xì)胞的基因表達(dá)。這項基于配位的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)（Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing，SPLiT-seq）是一項可延展的用于表征單個細(xì)胞RNA水平的技術(shù)，可用于鑒定腦部疾病及其他組織中的不同細(xì)胞類型，這項研究于近日發(fā)表在《Science》上。

“研究任何的多細(xì)胞生物系統(tǒng)，我們都需要明白它的基本組件——細(xì)胞。”艾倫學(xué)院科學(xué)家Bosiljka Tasic說道。“大腦包含很多不同形狀和大小的細(xì)胞，但是現(xiàn)在卻沒有一種方法可以表征它們并進(jìn)行分類。在單細(xì)胞水平鑒定RNA是一種鑒定細(xì)胞的方法，但是現(xiàn)有的技術(shù)太昂貴，且需要特殊的設(shè)備。由于SPLiT-seq可以通過任何實驗室的基礎(chǔ)設(shè)備完成，因此它將廣泛應(yīng)用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究。”

過去開發(fā)的測序技術(shù)需要在進(jìn)行基因標(biāo)記之前分離單個細(xì)胞。而采用SPLiT-seq就不需要再分離細(xì)胞了。取而代之的是，細(xì)胞本身就被作為了一個自身RNA的分離器。研究人員可以同時將大量細(xì)胞進(jìn)行RNA標(biāo)記，這個過程需要重復(fù)多次，以保證每個細(xì)胞都具有一組獨(dú)特的組合標(biāo)簽。這使得研究人員可以同時對大量的細(xì)胞進(jìn)行基因表達(dá)的測序，并將它們進(jìn)行分類。

“在這個項目中，我們使用SPLiT-seq對正在發(fā)育的小鼠大腦和脊髓中超過150000個細(xì)胞進(jìn)行了測序，我們發(fā)現(xiàn)了許多特殊細(xì)胞類型的新的分子標(biāo)記物。”華盛頓大學(xué)電氣工程系合成生物學(xué)家、Paul G.Allen計算科學(xué)和工程學(xué)院Georg Seelig教授說道。“我們的實驗成本為每個細(xì)胞一美分。SPLiT-seq顯著降低了實驗室進(jìn)行單細(xì)胞測序的障礙，同時不需要昂貴的特殊設(shè)備。”

“任何疾病，包括阿爾茲海默癥和帕金森，都起始于某些細(xì)胞的功能異常。”Tasic說道。“探索是哪些細(xì)胞以及哪些基因出錯將幫助我們更深入地了解這些疾病的起因及進(jìn)程，有利于我們開發(fā)新的治療方法。”