利用微生物培养基的景观来预测新的有机体媒体配对

KOMODO的内容被示出:

（a）该数据库的结构，示出主要表和信息点如何连接的地图。

（b-d）的生物体，培养基和营养成分存在于数据库中的号码。种子是指模型种子数据库16;看到KOMODO网站和方法的更多细节。

KOMODO揭示了媒体和复合使用全球格局

在KOMODO媒体使用和组成的典型模式可以揭示微生物营养的基本趋势，以及差距和调查偏见。为了获得这些关系的概述，我们建部分，媒体和生物分布直方图整个数据库（图2a-d）。我们观察到整个生物体跨越媒体组件使用，和介质的使用都遵循幂律，这表明一个'富人变得更加富有“结构表型和元件用途的分配（图2a，2b）。这种结构可能反映了趋同生物体之间的营养需求，在这种“成功”的媒体选择了人类调查，或两者生物体的优惠方式。

（a）在媒体组件的分布。这包括定义和复杂/不确定的成分，其中，不确定的成分被分组到其复杂的类别和各类别中存在的培养基计为一个组件。

（b）由生长在这些生物的多家媒体分布。

（c）生物体生长在媒体的数量分布。

（d）使它们内部组件的数目的媒体分布。知名媒体的的pH值分布。

（e）红色方块A和B表示用于功法配合垃圾箱。

（f）跨属40个最常用的媒体组件。此处列出离子典型地加入到媒体盐，其中我们假设完全离解在溶液中（例如，MgCl2的变为镁2+和Cl-）。

组件被分成四组：生物常见离子/化合物，微量金属/准金属，维生素/辅酶等。在每个组中，组件被他们跨越属使用频率的顺序排列，从多到少。留下的条形图是平均浓度横跨KOMODO在媒体的每个组件的，在日志10（摩尔浓度）为单位列出的列表。组件是属'差'，如果它出现在媒体在该属一些菌株，而不是其他。