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胎牛血清RNA干扰了细胞培养外源性RNA

2016-10-08 15:11

注:在用胎牛血清培养细胞时,有没有重视与对细胞培养FBS的RNA内容相关的生物学效应呢?想知道答案吗?请继续阅读。

胎牛血清(FBS,已在真核细胞培养物被使用了几十年。然而,很少受到人们的重视与对细胞培养FBS的RNA内容相关的生物学效应。在这里,用RNA测序,我们证明了FBS含有蛋白质编码和调控RNA物种,包括基因,miRNA的,rRNA基因和的snoRNA的不同剧目。他们中的大多数(>70%),甚至在囊泡耗尽FBS(vdFBS)在细胞外囊泡(EV)和细胞间通讯的研究通常使用的准备扩展超速离心后保留。FBS的相关联的RNA是共分离细胞培养物的细胞RNA(exRNA)和与下游RNA分析干扰。许多进化上保守的FBS衍生的RNA种类可以被错误地标注为人类或小鼠成绩单。

值得注意的是,在FBS的丰富特定的miRNA,如的miR-122中,miR-451A和miR-1246,先前已为富集在细胞培养衍生的电动汽车,可能是由于胎牛血清的混杂影响的报道。公开可用的数据集exRNA分析支持FBS污染的概念。此外,FBS转录可通过培养的细胞吸收,并影响高度敏感的基因表达谱技术的结果。因此,对于实验设计的预防措施是必要的,以减少因FBS衍生的RNA干扰和曲解。



通过培养细胞胞外囊泡(电动汽车)和脂蛋白复合物(的RNP)的形式发布外RNA(exRNA)的深度序列分析是研究一个扩展的领域。


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