如何鑒定細(xì)胞支原體污染？

養(yǎng)細(xì)胞可是個(gè)精細(xì)活，最怕遇到細(xì)胞污染了，這細(xì)菌和真菌污染好辨別，處理起來雖然麻煩，但是也能解決。相比起來，支原體污染才是防不勝防。顯微鏡很難捕捉到支原體，它與細(xì)胞共存在同一培養(yǎng)體系下，還跟細(xì)胞搶吃搶喝。辛苦培養(yǎng)的小細(xì)胞根本不是支原體的對(duì)手，只能茍活，導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)偏差。

多數(shù)情況下，發(fā)現(xiàn)細(xì)胞疑似支原體污染，直接丟掉然后清理環(huán)境即可。但在一些特殊實(shí)驗(yàn)，比如：細(xì)胞保種、抗體藥生產(chǎn)、疫苗生產(chǎn)或是細(xì)胞治療過程中，則需要對(duì)細(xì)胞例行支原體檢測(cè)，以確保細(xì)胞的純凈。

支原體熒光定量PCR檢測(cè)法（經(jīng)典法），簡稱支原體qpcr法（經(jīng)典法）

這里指的是基于經(jīng)典法試劑盒：Venor?Gem qEP的檢測(cè)方法。

關(guān)于qPCR大家應(yīng)該都不陌生：實(shí)時(shí)熒光定量PCR Quantitative Real-time PCR

是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中，以熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR）循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對(duì)待測(cè)樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。

在支原體經(jīng)典法檢測(cè)試劑盒中，無需RNA提取和反轉(zhuǎn)錄步驟，樣品僅需待檢測(cè)的細(xì)胞上清或是從上清中提取的DNA。

經(jīng)典法試劑盒：Venor?Gem qEP使用方法

一、樣品制備：

①濃縮：當(dāng)細(xì)胞長至90%時(shí)，即可收集上清開始檢測(cè)，可對(duì)樣品進(jìn)行適當(dāng)濃縮。

注：濃縮僅適用于支原體的完整性，避免濃縮前支原體被破壞（如熱滅活）。

②穩(wěn)定：細(xì)胞培養(yǎng)樣品可能含有豐富的DNA酶，在低溫下也能降解支原體DNA。因而推薦進(jìn)行樣品穩(wěn)定化處理。如果立即進(jìn)行DNA抽提，則忽略這一步。

③DNA 抽提：大量證據(jù)表明，DNA抽提可實(shí)現(xiàn)最高的靈敏度。DNA抽提有多種方法，但應(yīng)適合支原體基因組。我們推薦：

Venor?GeM Sample Preparation kits （貨號(hào)56-1010/-1050/-1200) 適合手動(dòng)DNA抽提

這些DNA抽提試劑盒已經(jīng)過大量驗(yàn)證，具體流程參見試劑盒說明書。另外Venor?GeM qEP kit包含的內(nèi)控DNA對(duì)照，也用于驗(yàn)證DNA抽提步驟（內(nèi)控原理：已知濃度的細(xì)胞，包含內(nèi)部控制DNA序列，該序列不和現(xiàn)有的任何有機(jī)體序列同源，對(duì)檢測(cè)的DNA樣品干擾極小。在DNA提取前，將該內(nèi)控細(xì)胞和樣品一起加入細(xì)胞裂解液中，被一起提取出來。和靶點(diǎn)樣品一起進(jìn)行熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)，內(nèi)控DNA序列的成功擴(kuò)增提示靶點(diǎn)DNA的提取成功）。

二、試劑制備與PCR

注：具體參數(shù)設(shè)置可點(diǎn)擊閱讀原文，登錄締一官方網(wǎng)站進(jìn)行查詢

另外，下列儀器已經(jīng)通過PCR反應(yīng)驗(yàn)證：

三、試劑制備與PCR

FAM通道檢測(cè)支原體熒光信號(hào)。依據(jù)DNA標(biāo)準(zhǔn)曲線和Ct值定量。具體步驟需參考具體qPCR 儀及軟件的功能。我們推薦對(duì)包括對(duì)照在內(nèi)的每個(gè)樣品的擴(kuò)增曲線進(jìn)行評(píng)估。

Ct＜40為陽性結(jié)果。Ct≥40為陰性結(jié)果。支原體DNA和內(nèi)控DNA存在信號(hào)的競爭性抑制。支原體DNA越多，F(xiàn)AM通道信號(hào)越高，檢測(cè)內(nèi)控對(duì)照的HEX通道信號(hào)越低。

德國Minerva Biolabs，專注于微生物污染控制試劑，支原體qPCR經(jīng)典法檢測(cè)，精度高、特異性高、操作簡便、售后服務(wù)完備。了解更多Minerva微生物污染控制試劑，歡迎訪問締一生物官網(wǎng)：www.dyshengwu.com。