Actin与GAPDH做内参区别

Actin与GAPDH作为内参在多个方面存在区别，以下将分别从定义、分布、作用、结构和应用等方面进行详细阐述：

定义：

Actin（肌动蛋白）：是细胞的一种重要骨架蛋白，分子量约为42kDa，基本上存在于所有真核细胞中。它作为内参是指为了衡量基因组数据的可靠性，使用序列保守性来测定从基因组中提取的某些基因的表达水平作为参考。

GAPDH（甘油醛-3-磷酸脱氢酶）：是一个管家基因，在物种间是高度保守的。例如，人源的GAPDH由335个氨基酸组成，其全长有70%与Arabidopsis thaliana中由422个氨基酸组成的同源蛋白是相同的。GAPDH在western blot和PCR中都被用作参照。

分布：

Actin：主要分布于细胞骨架中，是细胞运动、维持细胞形态和细胞分裂的重要成分。

GAPDH：广泛分布于各种组织中的细胞，存在于胞浆、细胞核、核周区及膜上。

作用：

Actin：β-Actin是PCR常用的内参，其抗体也是Western Blot很好的内参指数。

GAPDH：被广泛用作抽提total RNA，poly(A)+ RNA，Western blot等实验操作的标准化的内参。但值得注意的是，缺氧可上调GAPDH的表达，导致GAPDH聚集，因此不能在涉及氧气的相关研究中作为内参。

结构：

Actin与GAPDH在分子结构和氨基酸序列上存在显著差异，具体结构细节需要查阅相关生物学资料。

应用：

Actin：主要应用于生物化学与分子生物学、氨基酸、多肽与蛋白质、细胞生物学等领域。

GAPDH：除了作为内参用于实验标准化外，其蛋白印迹法也常用于实验分析中。

总结来说，Actin和GAPDH作为内参在定义、分布、作用、结构和应用上均有明显的区别。在选择内参时，应根据实验的具体需求和条件，综合考虑这些因素，选择最适合的内参。