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Actin與GAPDH做內(nèi)參區(qū)別

2024-06-07 15:36

Actin與GAPDH作為內(nèi)參在多個方面存在區(qū)別，以下將分別從定義、分布、作用、結(jié)構(gòu)和應(yīng)用等方面進行詳細闡述：

定義：

Actin（肌動蛋白）：是細胞的一種重要骨架蛋白，分子量約為42kDa，基本上存在于所有真核細胞中。它作為內(nèi)參是指為了衡量基因組數(shù)據(jù)的可靠性，使用序列保守性來測定從基因組中提取的某些基因的表達水平作為參考。

GAPDH（甘油醛-3-磷酸脫氫酶）：是一個管家基因，在物種間是高度保守的。例如，人源的GAPDH由335個氨基酸組成，其全長有70%與Arabidopsis thaliana中由422個氨基酸組成的同源蛋白是相同的。GAPDH在western blot和PCR中都被用作參照。

分布：

Actin：主要分布于細胞骨架中，是細胞運動、維持細胞形態(tài)和細胞分裂的重要成分。

GAPDH：廣泛分布于各種組織中的細胞，存在于胞漿、細胞核、核周區(qū)及膜上。

作用：

Actin：β-Actin是PCR常用的內(nèi)參，其抗體也是Western Blot很好的內(nèi)參指數(shù)。

GAPDH：被廣泛用作抽提total RNA，poly(A)+ RNA，Western blot等實驗操作的標(biāo)準(zhǔn)化的內(nèi)參。但值得注意的是，缺氧可上調(diào)GAPDH的表達，導(dǎo)致GAPDH聚集，因此不能在涉及氧氣的相關(guān)研究中作為內(nèi)參。

結(jié)構(gòu)：

Actin與GAPDH在分子結(jié)構(gòu)和氨基酸序列上存在顯著差異，具體結(jié)構(gòu)細節(jié)需要查閱相關(guān)生物學(xué)資料。

應(yīng)用：

Actin：主要應(yīng)用于生物化學(xué)與分子生物學(xué)、氨基酸、多肽與蛋白質(zhì)、細胞生物學(xué)等領(lǐng)域。

GAPDH：除了作為內(nèi)參用于實驗標(biāo)準(zhǔn)化外，其蛋白印跡法也常用于實驗分析中。

總結(jié)來說，Actin和GAPDH作為內(nèi)參在定義、分布、作用、結(jié)構(gòu)和應(yīng)用上均有明顯的區(qū)別。在選擇內(nèi)參時，應(yīng)根據(jù)實驗的具體需求和條件，綜合考慮這些因素，選擇最適合的內(nèi)參。