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【系列2】胎牛血清RNA干扰了细胞培养外源性RNA

2016-10-11 14:20

细胞衍生exRNA特定miRNA的富集可能是由FBS的衍生的RNA污染造成的。

几个观察表明FBS的相关联的RNA可能与exRNA的干扰分析。

首先,我们检测到高水平的miR-122,在肝脏中大量表达,但未被发现在其他组织中的特定的miRNA的2,3,在作为单层或神经球(培养的神经胶质瘤细胞系的条件培养基图1a)??悸堑饺鄙僭诔山褐?span style="font-size:15px;color:#FF0000;">细胞瘤肿瘤中的miR-122表达的4和培养的神经胶质瘤细胞(图1a)中,我们合理化,这一发现可以通过任一异常有效的miR-122的分泌来解释,或更可信,培养基作为主源这种miRNA的。实际上,的miR-122在神经胶质瘤细胞培养物中使用的新鲜无条件媒体高度丰富(图1b),这表明在经调节的培养基中的大多数的miR-122的来自于培养基成分,而不是细胞分泌。另一具体微小RNA中,miR-451A,在不同细胞和组织中的血表示具有最高丰度2,在由各种细胞类型分泌的电动汽车被报告为最富集的miRNA 5 ,6 ,7 ,8 ,9 ,10 ,11 。与这些发现一致的是,我们发现的miR-451A在从在DMEM/10%vdFBS(生长U251和20/3胶质瘤单层培养物的条件培养基中分离的丸状电动汽车富集图1a)。

然而,当相同的细胞系在相同的葡萄糖浓度,但在无血清的神经球促进条件下培养,未在超速离心检测的miR-451A(UC)粒料/exRNA级分(图1a)。为了更好地理解不同培养基的贡献,我们分离从新鲜无条件“单层培养基”总exRNAs(2D培养基含有DMEM/10%FBS),囊泡贫2D培养基(VD2D含有FBS的24小时后,UC),和“神经球介质”(3D介质,无血清),并使用定量RT-PCR测量的miR-451A水平。MIR-451A是丰富的2D介质,在VD2D介质略微减少,并且在3D介质(勉强检测图1b)。

值得注意的是,的miR-122和miR-451 VD2D媒体相对于所述粗2D介质中的水平降低到一个不同的程度,但不能完全消除。虽然该培养条件影响的RNA分泌的可能性不能被排除,这些研究结果表明,基于UC的囊泡耗尽不完全从FBS/培养基消除RNA和该FBS的相关联的RNA可能导致错误的结果和解释,如此前公布的miR-451A富集exRNA。

图1:FBS衍生的RNA干扰exRNA和细胞RNA的RNA分析。


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